Введение в биоинформатику

Биоинформатика — это применение компьютерных методов статистического и численного описания биологических явлений.  Она включает в себя аннотацию генов и белков, анализ канцерогенных мутаций, предсказание структуры белков, конкретные исследования клеточной биохимии и многое другое.

Цель данного курса — получить начальные теоретические знания о программном обеспечении для биоинформатики, его особенностях и ограничениях, а также дать учащимся возможность использовать самые популярные инструменты, доступные в  сети Интернет.

Методические рекомендации для  итогового исследовательского проекта по биоинформатике.

Исследовательский проект

1. Что такое исследовательский проект?

Исследовательский проект — это итоговая работа, которая должна учитывать, как теоретическую часть,  так и само исследование. Ваша задача – превратить  предварительную идею в научное исследование. При выполнении проекта от вас потребуется синтез ясности и конкретности как в изложении, так и в методологическом подходе.

Продемонстрируйте оригинальность вашего проекта по сравнению с предыдущими исследованиями на осуществимость темы.

1.1. Объект исследования 

Здесь вы четко описываете свой объект исследования. Проанализируйте исследования и публикации, которые считаются значимыми для вашего объекта, укажите пробелы в исследованиях в данной области,  обозначьте направления вашей деятельности.

Рекомендуется:

• определить ключевые проблемы по теме исследования
• продемонстрировать знания новейшей литературы по теме (это могут быть электронные журналы, научные ресурсы и пр.)

 1.2. Определение цели и задач исследования

Отправной точкой проекта служат определения цели и задач исследования.

Цель проекта  – это желаемый результат деятельности, достигаемый при реализации проекта в заданных условиях. Каждый проект включает как минимум одну цель. Цели разных участников проекта могут различаться и даже конфликтовать между собой. Достижение целей проекта характеризуется тремя основными показателями: качеством; временем; издержками.

Четкие, конкретные мероприятия, измеряемые в процессе реализации проекта, без выполнения которых его цель не будет достигнута, называются задачами проекта. Задачи, как и цели, должны быть реалистичными и формулироваться предельно четко и ясно.

Целесообразно:

• разбить раздел на вопросы, на которые необходимо ответить в ходе исследования.
• сформулировать общий вопрос, который представляет основную цель исследования, которую необходимо решить,
• следовать вопросам, которые уточняют объект/метод исследования.

1.3. Гипотеза исследования

1.4. Источники и инструменты анализа

Определите источники вашего исследования, необходимые для ответа на ваши вопросы и гипотезу.

Особенно рекомендуется:

• четко определить тип используемых источников и их оригинальность.
• указать доступность источников. Это может быть, как библиографическая ссылка, так и ссылка на электронный ресурс.

1.5. Методология исследования

Уточняется метод или методы и средства анализа, с помощью которых вы фактически готовы провести исследование. Вы указываете, как вы собираетесь организовать собранные данные (например: количественные, качественные, качественно-количественные, любые тематические исследования)

В частности, рекомендуется выделить:

• оригинальность предлагаемого метода анализа
• важность выбранного метода для ответов на вопросы исследования.

1.6. Актуальность исследования

Указывает, каковы ожидаемые результаты исследования, их важность в развитии науки.

1.7. План и график работы

Вы конкретно определяете свой собственный план исследования. Он может быть организован в виде таблицы планирования (дорожной карты) или любым другим удобным вам способом.

Дорожная карта  — это документ, в котором наглядно отображается стратегический план проекта: его главные цели и задачи, сроки исполнения основных этапов. Дорожная карта помогает всем участникам понять зачем нужен проект и что должно получиться в результате. Планирование можно сделать  на учебный год, полугодие  или четверть.

Например: Этап 1. Сбор и анализ литературы; Этап 2. Построение структуры исследовательской работы; Этап 3. Сбор данных; Этап 4. Анализ данных и пересмотр гипотезы исследования; Этап 5. Составление итогового проекта.

2. Структура проекта

• Название
• Оглавление
• Аннотация (введение). Миниатюрное, лаконичное резюме исследовательской работы, отражающее цель, исследовательский подход, результаты и выводы
• Объект исследования
• Цель и результаты, которых нужно достичь
• Задачи исследования и график их выполнения
• Ресурсы
• Теоретический раздел
• Практический раздел
• Матрица рисков проекта и план их минимизации.
• Заключение. Метод, вклад, который исследование может внести в научное сообщество
• Библиография
• Приложения

3. Библиография

Перечислите публикации, которые считаются важными для исследовательского проекта. Библиография должна быть составлена ​​полностью и всегда с указанием Автора/Авторов, Места и год выпуска издания.

Не забывайте также всегда упоминать ссылки на изображения.

Литература в списке приводится в следующем порядке:

1. Нормативно-правовые акты
2. Научная и учебная литература(книги,монографии,учебные пособия,учебно-методические пособия,справочники)
3. Конституция Российской Федерации.- М.:Эксмо,2013.-63 с.
4. Власов О.И.Толковый словарь О.И.Власов. – М.: Дрофа,2010. – 1020 с.
5. Водянец П.Л. Планирование на предприятии [Электронный ресурс]. – http://…(адрес указывается полностью) — статья в интернете
6. Иванов К.И. Основы права: учебник для вузов / К.И.Иванов.- М.: Дрофа,2012. – 256 с. Экономический словарь [Электронный ресурс]. – http://…(адрес указывается полностью)

4. Оформление

Проект должен иметь титульный лист.

Текст работы: шрифт Times New Roman (русифицированный) размером 12 кегль, цвет черный; поля верхнее, нижнее, левое, правое – по 2 см; межстрочный интервал – полуторный; абзацные отступы (красные строки) – 1,5 см; выравнивание текста – по ширине; расстановка переносов – автоматическая; номера страниц проставляются на каждой странице, кроме титульного листа (т.е. содержание – это страница № 2); параметры страницы: размер бумаги–формат А4; ориентация–книжная.

Новый раздел начинается с новой страницы. Теоретический и практический разделы должны иметь наименование (в соответствии и темой проекта). Название раздела печатается заглавными буквами, жирным шрифтом. Разделы нумеруются римскими цифрами. Список литературы и приложение не нумеруются. Список литературы формируется в соответствии с ГОСТом.